Adv Sci|上海药物所合作揭示海洋海绵萜类生物合成的分子进化机制

2026年8月18日,伟德bv1946官网徐宝福课题组联合烟台新药创制山东省实验室,在国际知名学术期刊《Advanced Science》在线发表题为“Investigations of the evolved molecular basis for terpenoid biosynthesis in marine sponges”的研究论文。该工作聚焦海洋海绵萜类天然产物的生物合成与分子进化核心科学问题,通过高质量基因组解析与多维度基因功能分析,系统阐述了海绵萜类合成体系的进化特征,为海洋动物萜类天然产物的生物合成途径解析与进化起源探索提供了重要理论基础。

Acanthella cavernosa隶属于寻常海绵纲,广泛分布于热带珊瑚礁海域。作为固着滤食生物,该物种缺乏物理防御结构,依赖异氰基萜类化合物抵御天敌与病原;这类化合物兼具多种生物活性,是海洋创新药研发的潜力资源。但天然海绵资源难以支撑药物规模化开发,且其活性萜类的合成来源——宿主本体或是共生微生物——长期存在学术争议。

针对这一核心科学问题,团队整合多组学技术与功能验证手段开展研究。通过PacBio HiFi长读长测序结合Hi-C染色体构象捕获技术,组装得到该物种染色体级别基因组(约267 Mb,挂载至25条染色体),BUSCO完整度达91%,为目前已报道的完整度处于领先水平的海绵基因组数据之一。

基于高质量基因组图谱,团队逐层解析萜类生物合成逻辑:前体供给层面,证实该海绵仅保留甲羟戊酸(MVA)通路,完全依赖古老真核代谢途径提供萜类合成前体;骨架构建层面,系统鉴定并验证了经典I型、非经典UbiA型及II型多类萜烯合酶的催化功能,明确了其可生成多种倍半萜与二萜产物。其中,团队首次在动物界发现具备萜类骨架合成功能的UbiA家族合酶AcUbiA1,其可催化生成该海绵特征二萜的核心biflorane骨架,为动物萜类合成机制补充了新的认知。

在演化与基因组架构维度,研究亦取得多项新发现:该海绵的I型萜烯合酶仅含单一α结构域,系统发育上更接近植物同源蛋白,提示其起源古老、经独立演化形成;与珊瑚中萜类合成基因成簇组织的模式不同,海绵相关基因呈分散分布,暗示早期动物的萜类代谢可能采用“分散式”网络布局。此外,研究还识别到一条整合了多物种来源基因的嵌合序列,或为海绵与共生体长期协同演化的分子痕迹。

本研究深化了对海洋动物萜类生物合成演化规律的理解,为后续完整解析海绵特色萜类合成途径、推进异源生物制造相关工作,提供了关键的基因组基础与理论参考。

该研究论文的共同第一作者为徐宝福课题组的博士后陈芳艳博士及副研究员陈宝博士。此外,徐宝福团队的多名研究生(上海药物所硕士生孙桂芳、宁波诺丁汉大学联培博士生赵耀及湖北大学联培硕士毕业生张文慧)以及上海图凌生物科技有限公司的张建朋也做出了重要贡献。该论文的通讯作者为徐宝福研究员。该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、山东省重点研发计划及山东省自然科学基金等项目的资助;上海药物所郭跃伟研究员及高级实验师姚励功对海绵样品采集提供了重要帮助。

全文链接:https://advanced.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/advs.77243

Acanthella cavernosa海绵中萜类化合物的生物合成与系统化学防御机制模式图

徐宝福课题组长期聚焦海洋动物萜类天然产物合成生物学前沿,深耕合成生物学与化学合成交叉研究,以“解析生物合成途径-构建高效合成底盘-化学衍生拓展结构”为核心脉络,致力破解海洋萜类资源受限难题,为创新药研发提供可持续的新颖萜类化合物资源。历经四年积累,课题组取得多项阶段性成果:解析珊瑚共生菌中新颖eunicellane型二萜合酶机制(Nat. Commun., 2024);阐明伪蕨素biflorane骨架合成机制并实现大肠杆菌发酵合成(Sci. Adv., 2025);挖掘改造spharoane骨架萜类合酶实现发酵量产(ACS Catal., 2025);搭建C10–C35全链反式萜类底盘,部分产物产量领域领先(Bioresour. Technol., 2026)。本研究就徐宝福课题组在海洋动物萜类合成生物学方向的又一阶段性成果,进一步丰富了海洋无脊椎动物萜类演化的研究认知。


(供稿部门:徐宝福课题组;审核:刁文桐;编辑:王肖成)